这种情况可能是由以下几个原因导致的：

1. 存款误操作：存款时可能发生了误操作，比如将100元存入了错误的账户或者选择了错误的存款方式。如果是这种情况，建议立即contact银行进行核实和调查，他们会帮助解决问题。

2. 手续费或其他费用：银行在处理存款和提款等交易时可能会收取一定的手续费或其他费用。这些费用可能会从存款金额中扣除，所以最终到账的金额会减少。

3. 汇率问题：如果存款是以外币进行的，那么汇率波动可能会导致最终到账金额有所变化。银行会按照当时的汇率进行兑换，所以最终到账的金额可能会略有差异。

4. 被盗或诈骗：在极少数情况下，可能存在银行账户被盗或者遭受诈骗的情况。这种情况下，存款金额可能被他人转移或者盗取，导致最终到账金额减少。如果怀疑自己的账户存在问题，应立即contact银行进行核实和处理。

总之，如果存100到银行卡只有50的情况发生，应该及时contact银行，提供相关信息并要求他们解释原因。银行会进行调查，并帮助解决问题。